Solvated ensemble averaging in the calculation of partial atomic charges
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Organizing atomic partial charges into a database
A partial charge database was constructed for 117 molecules. The actual database contains Mulliken, natural population analysis, and stockholder atomic charges calculated from the HF/6-31G(d) or HF/6-311þG(2d,p) wavefuntions. The MP2/631G(d), B3LYP/6-31G(d), or HF/6-31G(d) equilibrium geometries were used for these calculations. The database also contains the corresponding total energies calcul...
متن کاملPartial atomic charges of amino acids in proteins.
Using a semiempirical quantum mechanical procedure (FCPAC) we have calculated the partial atomic charges of amino acids from 494 high-resolution protein structures. To analyze the influence of the protein's environment, we considered each residue under two conditions: either as the center of a tripeptide with PDB structure geometry (free) or as the center of 13-16 amino acid clusters extracted ...
متن کاملAtomicChargeCalculator: interactive web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug-like molecules
BACKGROUND Partial atomic charges are a well-established concept, useful in understanding and modeling the chemical behavior of molecules, from simple compounds, to large biomolecular complexes with many reactive sites. RESULTS This paper introduces AtomicChargeCalculator (ACC), a web-based application for the calculation and analysis of atomic charges which respond to changes in molecular co...
متن کاملthe effect of the record infancy in crimilly acts of guilties (in karaj city)
چکیده یکی از مهمترین دغدغه های بزرگ جوامع بشری، از دیر باز تا کنون که ذهن پژوهشگران و متخصصان بهداشت روانی و اجتماعی و دولتها رابه خود مشغول داشته، مسأله ی بزهکاری می باشد. شناخت کامل پدیده ی بزهکاری و بزهکار، علل وعوامل سقوط یک انسان، چگونگی درمان وی و درنهایت پیشگیری ازبزهکاری ودریک کلام سالم سازی یک جامعه، رسالت عظیم، انسانی ومقدسی می باشد که با بررسی شخصیت مجرم یعنی[ انسانی که تحت شرای...
15 صفحه اولromantic education:reading william wordsworths the prelude in the light of the history of ideas
عصر روشنگری زمان شکل گیری ایده های مدرن تربیتی- آموزشی بود اما تاکید بیش از اندازه ی دوشاخه مهم فلسفی زمان یعنی عقل گرایی و حس گرایی بر دقت و وضوح، انسان عصر روشنگری را نسبت به دیگر تواناییهایش نابینا کرده و موجب به وجود آمدن افرادی تک بعدی شد که افتخارعقلانیتشان، تاکید شان بر تجربه فردی، به مبارزه طلبیدن منطق نیاکانشان وافسون زدایی شان از دنیا وتمام آنچه با حواس پنجگانه قابل درک نبوده و یا در ...
ذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Journal of Computational Chemistry
سال: 2001
ISSN: 0192-8651,1096-987X
DOI: 10.1002/jcc.1072